ADN environnemental et diatomées, c’est pas sourcier !

© Arnaud Guggisberg

Plus de 65’000 km de rivière parcourent le paysage suisse et le façonnent depuis des millénaires. Découvrez les secrets des algues microscopiques présentes dans nos lacs et rivières, les diatomées, et évaluez l’impact des activités humaines sur ces écosystèmes par l’analyse de leur ADN.

Durant cette activité organisée sur trois rencontres, vous partez dans un premier temps récolter des échantillons sur le terrain, dans une rivière à proximité. Vous êtes initié·e·s à la dynamique des cours d’eau et aux problématiques des activités responsables de pollutions, ce qui permet de mieux comprendre et de quantifier la pression de celles-ci sur l’environnement.

Diatomées prélevées, vous vous rendez au laboratoire de L’éprouvette, le temps d’une demi-journée, afin d’en extraire l’ADN. Par des méthodes innovantes utilisées dans les laboratoires de recherches, vous amplifiez et séquencez cet ADN afin d’identifier les espèces de diatomées présentes dans votre échantillon. Sur le campus de l’UNIL, vous avez ensuite la possibilité de visiter la plateforme de génomique qui séquencera vos échantillons !

À l’issue du séquençage, la troisième et dernière session permet d’analyser les données obtenues. Vous identifiez et quantifiez les espèces analysées par des méthodes de bio-informatique. Vos élèves peuvent ensuite en déduire un indice de la qualité de l’eau, l’indice diatomée, et conclure sur l’état de santé du cours d’eau. Résultats en poche, ils et elles sont amené·e·s à réfléchir et à débattre sur les thématiques de la santé des cours d’eau et de la préservation de cette ressource essentielle à la vie sur Terre.